Das Martin-Heidegger-Museum erstreckt sich über drei Räume im Erdgeschoss des Schloss-Ostflügels. Thematisch deckt die Schau vier Bereiche ab: Neben einer Lebenschronik werden die wichtigsten Stationen der philosophischen Entwicklung Heideggers vorgestellt. Kleinere Abteilungen der Ausstellung befassen sich mit den Themen „Heidegger als Sohn Meßkirchs“ und „Heidegger und die Kunst“. Auch Werke von mit Heidegger verbundenen Künstlern wie Eduardo Chillida oder Otto Dix werden ausgestellt.